宝德HPC揭开大熊猫基因秘密

    金秋十月的深圳第十届中国高新技术成果交易会上，宝德科技因其生产的HPC高性能计算机揭开国宝大熊猫基因秘密倍受瞩目。深圳华大基因研究院十月宣布，中华大熊猫“晶晶”基因组框架图绘制完成。这也是中国科学家继去年完成第一个黄种人基因组图谱后，在生命科学领域又一里程碑式的贡献。
    早在今年3月份，由中国科学家发起，加拿大、英国、美国、丹麦等国家的科学家联合参与的国际大熊猫基因组研究项目启动。大熊猫基因组包含约2万~3万个基因，这个项目的作用在于能够揭示大熊猫极强的环境适应能力及其进化的分子机理，而且利于大熊猫疫病控制，以保护濒危品种，同时也可为大熊猫的人工繁殖提供科学依据。曾经作为2008北京奥运会吉祥物的原型之一的大熊猫晶晶，成为国际大熊猫基因组研究项目的首个测序对象，华大基因研究院的科学家，利用宝德科技提供的高性能计算机顺序地完成了大熊猫基因的测序任务。

    负责主持这一项目的王俊博士说：“大熊猫共有21对染色体，基因组大小与人类相似约为30亿个碱基对，包含2-3万个基因。我们的研究工作量巨大，如果将大熊猫基因组序列写成一本书，其厚度相当于384米高的大厦。”据介绍，华大自主研制的全基因组组装软件及自主搭建的高性能计算平台在其中发挥了关键性的作用。这一基因组序列图的绘制，采用了新的测序技术，使得测序的速度大大提高，成本大大降低。这是全世界靠前个用这项新技术完成的标志性的大型基因组序列图。这一成果也在一定程度上体现了中国的国家竞争力和深圳市的城市创新能力。
    宝德参与大熊猫基因研究的是POWER Cluster8000 HPC计算机系统，宝德POWER Cluster8000 HPC系统采用分层设计，按照高性能计算生态系统部署，自上而下，包括HPC并行应用程序、中间件集群管理、通信库以及各类软件优化工具、操作系统、计算节点和主控节点的硬件平台、互联网络系统等。方案具有开放性、可扩展、性价比高的特点，满足基因研究的应用需求。
宝德HPC计算机系统包括标准42U电信机柜，管理节点服务器、存储节点服务器、计算节点服务器，操作系统及应用软件等。其中管理节点服务器采用宝德PR2700服务器，存储节点采用PR3015S，计算节点采用宝德PR1700H高密度节能服务器。宝德“双子星”系列1U服务器PR1700H，是一款高计算密度的机架式服务器，采用四核及45纳米芯片技术，节省空间，倍增集成能力、将原先两台1U机架式产品，集成到1U空间内；相当于两台服务器集成，可以独立控制和管理运行。
    宝德作为中国最主要的服务器厂商，时刻站在服务器技术的前沿，在HPC高性能计算领域有着独特的优势。目前宝德又在深圳观澜工业园区建成亚洲最大的服务器研发制造基地，同时宝德还是全球ISA解决方案联盟的唯一中国成员，其安腾服务器销量连续5年获得国内第一名，亚州排名第二；其机架服务器也连续7年销量排前，成为名副其实的“机架王”。同时是英特尔在中国最重要的战略合作伙伴之一，英特尔在深圳的服务器研发、生产将主要依托宝德研发生产基地。